五月中，合肥分厂传来了第一个信号，由于连日降雨，饲料厂的原料出现了发霉现象，李耒马上做出安排，让他们调整生产计划，做好预防洪水的准备，分厂的负责人有些犹豫，他觉得虽然今年的雨确实比去年的厉害一些，但也不至于到发洪水的程度吧？调整生产计划可是要损失产能的。
李耒严厉要求他必须按照自己的命令办，同时如果因为自己的命令让厂子的效益下降，那么在年终考核的时候不会对他做出惩罚，但要是他阴奉阳违没有好好准备，结果洪水来了导致厂子出现损失，那就开除他。
饲料厂的人终于没话说了，养殖场的梁天胜也是一样，但是他们遇到的问题要更加严重一些，因为饲料厂调整生产计划，顶多就是减少原料采购、降低销售就行了，他们还得处理养殖场里的鸡和猪。
真遇到大洪水，这些鸡跟猪肯定跑不了，就算淹不到这儿，饲料供应也会断掉，因为这次洪水对合肥影响很大，交通断了不少，到那时候就算还可以进出，恐怕道路也全被救灾部队占了，那还能让他们运饲料？
商品代鸡、猪直接便宜处理掉，那怕没到销售时间买不上价钱也总比眼睁睁看着它们饿死的好；父母代种鸡送往杭州或者上海距离比较近的养殖场，等这边恢复了再运回来。
化肥厂也没闲着，水淹后农作物根部的有氧呼吸受到抑制，养分供给能力减弱，营养物质分解能力降低，会出现嫩梢萎蔫甚至枯萎；同时由于无氧呼吸加强，导致乙醇、丙酮酸、乳酸等物质的积累，产生毒害。
这时候就要采取一些措施来挽救收成，首先自然是尽快排水，然后及时追肥，喷洒农药预防病虫害，所以李耒也让化肥厂开始加班生产化肥、农药。
同时还让他们对员工进行针对性培训，教会他们遇到洪水该怎么处理，先提前把家里的细软收拾好，洪水发生后又该往那些相对安全的地方跑，这时候千万别顾忌家里的东西，保住人命才是第一位的。
另外把饲料厂、养殖场的仓库都腾出来，四处认真检查一遍，然后进行修补，做好防洪水的准备，等他们收拾好之后，食品厂就把火腿肠、方便面源源不断地送过去，另外还大量采购了救生圈、救生衣、各种药品等物资存在这些地方，这样等洪水来的时候就能派上用场了。
这次洪灾一共波及十八个省，其中五个省比较严重，又以安徽、江苏两个省最厉害，合肥、杭州、上海有自家工厂，可以准备地更加充分一些，其它地方李耒也没有忽视，都安排了人提前在当地地势比较高、受洪水影响比较小的地方租了仓库，同样提前做好了准备。
各家分厂的货车都进行了专门的检修，务必把状态调整到最好，另外也对他们进行了专门的培训，车上也同样准备了救生圈、救生圈和急救包，惠农招收的退伍军人多，医务兵也不少，让他们培训倒也方便。
一开始工人们还觉得有点新鲜，天天在厂里干活难免无聊，偶尔换个项目倒也挺有意思的，但是时间一长就觉得无聊了，于是一个个怪话都出来了，同时供货商和客户对他们减产也有不小的意见，合肥分厂的管理层承受了不小的压力。
等到六月份的时候，员工的怪话和客户的牢骚就降低了不少，因为从6月8日至15日这几天，合肥平均降雨量达到了250毫米以上、少数地区甚至高达357毫米，是正常年份的四到五倍。
这下不光惠农的工人在培训的时候不敢嘻嘻哈哈了，就连当地政府也做出反应，迅速抽调精干人员组成防洪小组，但他们都没有想到，这次的洪水有多厉害。
六月中暴雨湿润的土地尚未干涸，六月底到七月初又普降大暴雨，降雨量比上次还要高，市区490毫米，肥东、肥西、长丰分别达548、480和402毫米，这下大家都意识到了问题的严重性。
李耒也抓紧了物资的采购和运输，那怕是这么干会影响到惠农的正常经营也在所不惜，厂里那些退伍军人出身的司机从周边各地，把一批批物资前往合肥、南京以及其它会遇到洪水的城市的仓库中。
除了物资，李耒在人员方面也做了准备，他在惠农成立了以退伍军人为骨干的志愿者队伍，等洪灾发生后就会带着他们第一时间赶往现场，负责协助当地干部和军队做一些力所能及的事。
7月11日下午，这场灾害终于来了，首先遭遇洪灾的地方是三河，当时暴雨越下越猛，外河水位超出警戒水位2.23米，杨婆大堤新圩段溃破；洪水像一匹脱缰的野马冲出堤坝漫向街区，五米高的浪头排空而来，短短的23分钟，洪水以迅雷不及掩耳之势，灌满了4.6平方公里的地方，繁华的古镇一片汪洋，所有工厂、商店无一幸免，三河遭受了灭顶之灾。
灾害发生后不久，救灾队伍第一时间抵达现场，1000余名解放军指战员、武警官兵和公安干警全力开展营救，营救人员划着小船，穿街入巷，从危房内、房顶上抢救出一批批群众，从7月11日下午至7月15日，三河镇安全转移被洪水围困的群众共6000多人。
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